醫院的污水，除一般生活污水外，還含有化學物質、放射性廢水和病原體。因此，必須經過處理后才能排放，特別是肝炎等傳染病病房排出來的污水，須經消毒后才可排放。全椒縣人民醫院廢水主要來源：醫療廢水，門診、醫技樓、病房樓含菌廢水及生活糞便污水、食堂廢水、辦公及生活洗滌廢水等。該院采用了的衛生院污水處理設備。衛生院污水處理設備適用于住宅區、賓館、療養院、學校、礦山、工廠等生活有機污水處理與之類似的工業有機污水處理。