目前由于我國畜禽場飼養(yǎng)管理方式落后，加上綜合利用前厭氧處理的不到位，常使畜禽糞水在綜合利用的過程中產(chǎn)生許多問題，如廢水產(chǎn)生量大、成分復(fù)雜、處理后污染物濃度仍很高、所用稀釋水量多和受季節(jié)灌溉影響等。對于處理達(dá)標(biāo)排放的來講，雖然國內(nèi)外所用的工藝流程大致相同，即固液分離-厭氧消化-好氧處理。無論畜禽養(yǎng)殖場廢水采用什么系統(tǒng)或綜合措施進(jìn)行處理，都必須行固液分離，這是一道*的工藝環(huán)節(jié)，其重要性及意義主要在于：先，一般養(yǎng)殖場排放出來的廢水中固體懸浮物含量很高，可達(dá)160000mg/L，相應(yīng)的有機(jī)物含量也很高，通過固液分離可使液體部分的污染物負(fù)荷量大大降低；其次，通過固液分離可防止較大的固體物進(jìn)入后續(xù)處理環(huán)節(jié)，防止設(shè)備的堵塞損壞等。此外，在厭氧消化處理前進(jìn)行固液分離也能增加厭氧消化運(yùn)轉(zhuǎn)的可靠性，減小厭氧反應(yīng)器的尺寸及所需的停留時(shí)間，降低設(shè)施并提高COD的去除效率。固液分離技術(shù)一般包括：篩濾、離心、過濾、浮除、沉降、沉淀、絮凝等工序。

   國內(nèi)外對規(guī)模化畜禽場糞水的處理方法主要有綜合利用和處理達(dá)標(biāo)排放兩大類。綜合利用是生物質(zhì)能多層次利用、建設(shè)生態(tài)農(nóng)業(yè)和保證農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展的好途徑。由于養(yǎng)殖業(yè)廢水屬于高有機(jī)物濃度、高N、P含量和高有害微生物數(shù)量的“三高”廢水。因此厭氧技術(shù)成為畜禽養(yǎng)殖場糞污處理中*的關(guān)鍵技術(shù)。對于養(yǎng)殖場這種高濃度的有機(jī)廢水，采用厭氧消化工藝可在較低的運(yùn)行成本下有效地去除大量的可溶性有機(jī)物，COD去除率達(dá)85%～90%，而且能殺死傳染病菌，有利于養(yǎng)殖場的防疫。如果直接采用好氧工藝處理固液分離后的養(yǎng)殖業(yè)廢水，雖然一次性可節(jié)省20%，但由于其消耗的動力大，電力流水消耗是厭氧處理的10倍之多，因此的運(yùn)行費(fèi)用將給養(yǎng)殖場帶來沉重的負(fù)擔(dān)。

   目前用于處理養(yǎng)殖場糞污的厭氧工藝很多，其中較為常用的有以下幾種：厭氧濾器（AF）、上流式厭氧污泥床（UASB）、復(fù)合厭氧反應(yīng)器（UASB＋AF）、兩段厭氧消化法和升流式污泥床反應(yīng)器（USR）等。近年來，厭氧消化即沼氣發(fā)酵技術(shù)已被廣泛地應(yīng)用于養(yǎng)殖場廢物處理中，到2002年底我國畜禽養(yǎng)殖場大中型沼氣工程數(shù)量已經(jīng)達(dá)到2000余處，是世界上擁有沼氣裝置數(shù)量較多的之一。雖然，在我國的沼氣工程建設(shè)中也不乏失敗的例子，工程建設(shè)成功率僅為85%，但這一技術(shù)不失為解決畜禽糞便污水的無害化和資源化問題的有效的技術(shù)方案。畜禽糞便和養(yǎng)殖場產(chǎn)生的廢水是有價(jià)值的資源，經(jīng)過厭氧消化處理既可以實(shí)現(xiàn)無害化，同時(shí)還可以回收沼氣和有機(jī)肥料，因此建設(shè)沼氣工程將是中小型養(yǎng)殖場糞便污水治理的選擇。

   好氧處理是指利用好氧微生物處理養(yǎng)殖廢水的一種工藝。好氧生物處理法可分為天然好氧處理和人工好氧處理兩大類。

   天然好氧生物處理法是利用天然的水體和土壤中的微生物來凈化廢水的方法，亦稱自然生物處理法，主要有水體凈化和土壤凈化兩種。前者主要有氧化塘（好氧塘、兼性塘、厭氧塘）和養(yǎng)殖塘等；后者主要有土地處理（慢速滲濾、快速法濾、地面漫流）和人工濕地等。自然生物處理法不僅基建費(fèi)用低，動力消耗少，該法對難生化降解的有機(jī)物、氮磷等營養(yǎng)物和細(xì)菌的去除率也高于常規(guī)的二級處理，部分可達(dá)到三級處理的效果。此外，在一定條件下，該法配合污水灌溉可實(shí)現(xiàn)污水資源化利用。該法的缺點(diǎn)主要是占地面積大和處理效果易受季節(jié)影響等。但如果養(yǎng)殖場規(guī)模小且附近有廢棄的溝塘和灘涂可供利用時(shí)，應(yīng)盡量選擇該方法以節(jié)約和處理費(fèi)用。人工好氧生物處理是采取人工強(qiáng)化供氧以提高好氧微生物活力的廢水處理方法。